Интересно, что в средневековых сочинениях параллельно, не мешая друг другу, существовали две медицины, базирующиеся на двух различных учениях о строении человека. Медицинские трактаты основывались на анатомических знаниях, добытых эмпирическим путем и более или менее реально отражавших , анатомию человека. В йогической же и тантрической литературе давалась скорее воображаемая, чем реальная структура внутренних органов. Живучесть йогических представлений об анатомии объясняется тем, что йога в целом не ставила целью лечение болезней, а служила теоретическим обоснованием определенной практики поведения, которая должна привести к физическому и психическому совершенству человека.
Известное развитие получила также химия. В связи с этим надо упомянуть сочинения Говиндабхагаваты (XI в.) и Сома-девы (XII—XIII вв.).