В конце августа 2018 г. стало известно об уголовном деле по фактам злоупотреблений в «Трансаэро». Возглавлявший компанию с ноября 2015 г. по сентябрь 2017 г. Александр Бурдин подозревается в невыплате зарплат сотрудникам, растрате и злоупотреблении полномочиями. Дело расследует Московское межрегиональное управление на транспорте.
Как сообщают «Ведомости», в материалах дела есть и другой эпизод. Неустановленные лица из числа руководства «Трансаэро» злоупотребили полномочиями против интересов перевозчика с целью извлечения выгоды для других лиц. Они подписали допсоглашение, лишив «Трансаэро» права на получение субсидий за перевозки на сумму не менее 610 млн RUB.
Речь идет о соглашении к договору о перевозках на Дальний Восток, которое было подписано главой Росавиации Александром Нерадько и руководившим в то время «Трансаэро» Дмитрием Сапрыкиным. В том документе сумма полагающихся авиакомпании субсидий изменена с 1,095 млрд RUB на 485 млн RUB без объяснения причин.
По данным «Ведомостей», следствие намерено проверить законность действий Сапрыкина и Нерадько, а также провести экспертизу на подлинность их подписей.